L’église Sainte-Croix de Saint-Pourçain-sur-Sioule, anciennement prieurale et aujourd’hui paroissiale, est un édifice complexe dont les parties les plus anciennes remontent au XIème siècle. De la reconstruction commencée à la fin du XIIème siècle et poursuivie au cours des XIIIème et XIVème siècles, il subsiste le vaste chœur à déambulatoire et les chapelles rayonnantes. La construction de la nef s’étala péniblement au cours des XVème et XVIème siècles et ne fut jamais achevée, conservant aujourd’hui un aspect hétéroclite et difforme.
Une voûte lambrissée vint couvrir le chœur et la nef au XVIème siècle, elle était percée de lucarnes destinées à éclairer le vaisseau central. Au cours du XIXème siècle, au lieu de restaurer les lambris, on préféra recouvrir la voûte d’une couche de plâtre fixée sur des lattis, les lucarnes furent supprimées, plongeant la nef dans l’obscurité. Cette voûte fut restaurée et le plâtre retiré au début du XXIème siècle lors des campagnes de restauration de l’église. Cette charpente en carène de bateau (coque de bateau renversée) fait la particularité et la splendeur de cet édifice.
À l’intérieur, le chœur dont le rond-point comporte des arcs aigus lui confère un certain cachet. Le porche nord a conservé les niches et les bases de ses anciennes statues colonnes, détruites à la Révolution.
Les stalles de moines bénédictins du XVème siècle, la statue de l’Ecce homo en pierre polychrome de la fin du XVIème siècle et le maître-autel du XVIIIème siècle constituent les plus beaux objets conservés à l’intérieur de cette église.
Depuis une vingtaine d’année, l’église Sainte-Croix a bénéficié de plusieurs campagnes de restauration. Le narthex, les toitures, l’entrée nord du bâtiment ou bien encore l’éclairage et le chauffage de l’église font partis des éléments rénovés par la Ville de Saint-Pourçain-sur-Sioule.


L’église Sainte-Croix a la chance de pouvoir posséder en son sein un orgue de 1866 conçu par le célèbre facteur d’orgue Aristide Cavaillé-Coll. Composé de 18 jeux répartis sur deux claviers et un pédalier de trente notes, l’orgue de l’église Sainte-Croix est installé sur la tribune au dessus de l’entrée de l’édifice. L’orgue, classé Monument historique depuis 1972, a bénéficié de restaurations en 1937, 1979 et 2025.

En mars 2004, pour permettre des travaux de rénovation de l’intérieur de l’église, l’orgue est démonté et entreposé. De 2020 à 2025, un grand projet de restauration de l’orgue a été mené. Cette restauration, dont le coût total est de 302 700 €, a été cofinancée par la DRAC Auvergne-Rhône-Alpes, la Région Auvergne-Rhône-Alpes, le Conseil départemental de l’Allier et la Fondation du Patrimoine.
Au sein de l’église Sainte-Croix de Saint-Pourçain-sur-Sioule se trouve le tableau « Assomption ». Signée de l’artiste Moulinois Gilbert Sève, cette œuvre de près de 3 mètres de haut et 2 mètres de large est datée de 1642.
Au cours de l’année 2024, ce tableau a bénéficié d’une restauration complète avant d’être exposé au sein du musée Anne-de-Beaujeu de Moulins dans le cadre de l’exposition « Trésors du baroque ». Aujourd’hui, ce tableau est installé dans l’église Sainte-Croix pour y être découvert librement par les visiteurs.

La restauration de ce tableau, d’un coût de 13 007,50 €, a été cofinancée par l’État (DRAC) à hauteur de 5 912 € et par la Région Auvergne-Rhône-Alpes à hauteur de 1 773 €.